Del ojo a los datos, sin esfuerzo

Segmentación mediante ejemplos basada en aprendizaje profundo para imágenes 2D y 3D

Aivia 15 proporciona a los científicos herramientas intuitivas para obtener datos valiosos, sin necesidad de experiencia en IA. Simplemente pinte sobre las células de interés para una detección basada en aprendizaje profundo (modificado a partir de Cellpose1), lo que garantiza una segmentación precisa adaptada a las variaciones celulares. 

Segment by Example permite a cualquier científico aprovechar la IA para obtener información rápida sin formación en codificación ni en modelos de aprendizaje profundo.

1. Stringer C, Wang T, Michaelos M, Pachitariu M. Cellpose: a generalist algorithm for cellular segmentation. Nature Methods. 18: 100-106. (2021)

Imagen de 48 canales de colon humano adquirida en el sistema Leica Cell DIVE, analizada mediante Aivia Segment by Example y coloreada por mediciones de circularidad. Crédito de la imagen: Melinda Hill, Ph.D. de Leica Microsystems, analizada en Aivia por Quyen Tran, Ph.D. de Leica Microsystems
Imagen de 48 canales de colon humano adquirida en el sistema Leica Cell DIVE, analizada mediante Aivia Segment by Example y coloreada por mediciones de circularidad. Crédito de la imagen: Melinda Hill, Ph.D. de Leica Microsystems, analizada en Aivia por Quyen Tran, Ph.D. de Leica Microsystems

Análisis optimizado con Aivia Launchpad 

Aivia Launchpad simplifica el análisis cuantitativo con secuencias guiadas preestablecidas y tutoriales. 

Aivia presenta opciones de análisis relevantes basadas en el punto final y las dimensiones de la imagen deseados.

Personalice su análisis con la función Flexible Chevrons, que permite modificar, guardar, recargar y compartir flujos de trabajo.

Aivia Launchpad ayuda a los usuarios a iniciarse en el análisis de objetivos mediante una guía tutorial y lanzando la secuencia guiada preestablecida para el flujo de trabajo de análisis.
Aivia Launchpad ayuda a los usuarios a iniciarse en el análisis de objetivos mediante una guía tutorial y lanzando la secuencia guiada preestablecida para el flujo de trabajo de análisis.

Acceso a la IA para todos

Aivia pone el análisis avanzado de datos al alcance de todos los biólogos,  sin necesidad de conocimientos informáticos.

La plataforma Aivia ha sido diseñada pensando en el usuario final. Esto significa que con Aivia puede generar resultados de alta calidad de forma rápida y fiable. La plataforma Aivia incluye todas las aplicaciones de última generación que necesitará en una experiencia de usuario unificada.

Forme rápidamente a los usuarios del laboratorio en el uso de la plataforma, para que realicen sus análisis sin necesidad de conocimientos especializados.

  • Acelere sus proyectos de imagen y publique más rápido
  • Benefíciese de las herramientas de segmentación y clasificación basadas en machine learning fáciles de usar y de última generación
  • Realice la segmentación de las imágenes sin parámetros
  • Cree, actualice y aplique fácilmente modelos de deep learning utilizando recursos locales o la plataforma AiviaCloud

Exploración de datos sin esfuerzo para obtener información más detallada 

Fenotipe fácilmente mediante la delimitación de regiones (gating) basada en mediciones o directamente en gráficos (diagrama de dispersión/reducción de la dimensionalidad). Utilice los selectores de medición para navegar rápidamente por los gráficos en función de distintas mediciones. 

Obtenga información a partir de grandes conjuntos de datos con nuestra nueva visualización de gráficos de dispersión agrupada por mapa de calor. Comparta sus hallazgos con informes de resumen automatizados, incluidos metadatos, ajustes de segmentación, resultados de fenotipado y gráficos.

Genere datos rápidamente a partir de diferentes mediciones actualizando los gráficos con selectores de mediciones. Crédito de la imagen: sección de tejido de cáncer ductal pancreático por Melinda Hill, Ph.D., Leica Microsystems., analizada con Aivia por Won Yung Choi, Ph.D. de Leica Microsystems.
Genere datos rápidamente a partir de diferentes mediciones actualizando los gráficos con selectores de mediciones. Crédito de la imagen: sección de tejido de cáncer ductal pancreático por Melinda Hill, Ph.D., Leica Microsystems., analizada con Aivia por Won Yung Choi, Ph.D. de Leica Microsystems.
Racimo de organoides de dos colores

Segmentación radicalmente simplificada

La capacidad de análisis basada en IA de Aivia se vale de la experiencia de los biólogos para generar resultados de segmentación robustos y reproducibles.

Esto significa que con Aivia puede generar resultados de alta calidad de forma rápida y fiable, lo que le ayudará a agilizar su camino hacia la publicación y a descubrir detalles ocultos en sus datos.

Supere los retrasos causados por tareas de segmentación propensas a errores y tediosas, y libere a su equipo del trabajo de laboratorio, que requiere mucho tiempo, para que pueda centrarse en la innovación y el descubrimiento.

  • Comparta directamente los protocolos de análisis de imagen
  • Benefíciese de los protocolos optimizados de procesamiento de imágenes diseñados y probados más de 250.000 veces por expertos
  • Dispone de detección y seguimiento de células en 2D y 3D, así como de un conjunto de herramientas predictivas para la reconstrucción de neuronas en 3D
Dapi - Núcleo, GFP - Membrana plasmática, Grosor 100 µm, objetivo 63x, 469 planos Z, 2 canales, Sistema de imagen THUNDER para cultivos celulares en 3D. Cortesía de Diana Krauß, Universidad de Medicina de Viena (Austria).
Dapi - Núcleo, GFP - Membrana plasmática, Grosor 100 µm, objetivo 63x, 469 planos Z, 2 canales, Sistema de imagen THUNDER para cultivos celulares en 3D. Cortesía de Diana Krauß, Universidad de Medicina de Viena (Austria).

Datos 3D hasta un 69 % más rápido y creador de flujos de trabajo fácil de usar 

Acelere en hasta un 69 % la obtención de datos 3D2 con nuestra creación de mallas y alisado más rápidos para todas las canalizaciones de análisis 3D. Cree fácilmente análisis por lotes para objetos, fenotipos, relaciones espaciales, clasificación y modificación de canales mediante el creador de flujos de trabajo. 

Genere información sobre colocalización basada en objetos (solapamiento parcial, total y basado en %) y análisis de vecino más cercano (más cercano, 5 más cercanos y todos en el rango de búsqueda) para cualquier conjunto de objetos o fenotipo.

  • Obtenga datos más rápidamente con una aceleración del 69 % en canalizaciones de análisis 3D.
  • Exporte células sobre la base de fenotipos a los microscopios de disección láser de Leica con asignación automática a placas multipocillo o tubos de recolección.
  • Importación mediante arrastrar y soltar de 26 modelos de Bioimage.io en Aivia, con compatibilidada con nuevos formatos de archivo.

2. Mayor velocidad en comparación con Aivia 14

Un ejemplo del mapa de calor del vecino más cercano entre el clúster 3 (celdas cian) y el clúster 12 (mapa de calor arcoíris) con las células más cercanas en rojo y las más lejanas en azul.
Un ejemplo del mapa de calor del vecino más cercano entre el clúster 3 (celdas cian) y el clúster 12 (mapa de calor arcoíris) con las células más cercanas en rojo y las más lejanas en azul.

Libertad total en una única plataforma

La potente y rápida visualización y análisis 2-5D de Aivia libera todo el valor de sus datos dentro de una única plataforma.

Su equipo ya no tendrá que aprender a manejar y adoptar múltiples sistemas de imagen y análisis en su flujo de trabajo, ya que la plataforma Aivia aúna todas las aplicaciones de última generación que necesitará en una experiencia de usuario unificada. Aivia puede aprovechar recursos de computación tanto locales como en la nube. Puede instalar y utilizar Aivia tanto en su ordenador local como a través del navegador web AiviaWeb. Aivia funciona a la perfección con todos los sistemas de imagen de microscopía.

Su equipo también puede acceder a todos los archivos creados por sus sistemas de imagen desde cualquier lugar: todo lo que necesita es una conexión a Internet.

  • Visualización y análisis 2D-5D rápidos y potentes: accesibles desde cualquier lugar
  • Incluye 22 aplicaciones y 20 modelos preentrenados de deep learning (segmentación y restauración de imágenes y tinción virtual)
  • Acceso fiable y sencillo a la nube con arquitecturas informáticas flexibles
  • Compatible con más de 45 formatos de archivos de microscopía

Empiece una prueba gratuita

Basada en una arquitectura de software «IA primero» de última generación, Aivia es una plataforma especialmente innovadora y completa de visualización, análisis e interpretación de imágenes de 2 a 5D, diseñada para el procesamiento y la reconstrucción fiables de imágenes altamente complejas en cuestión de minutos.

  • Permita que el análisis de imagen mejorado con IA sea accesible para todos, sin necesidad de conocimientos previos de informática
  • Aproveche las capacidades de aprendizaje automático para generar resultados de segmentación sólidos y reproducibles
  • Obtenga visualizaciones y análisis 2D-5D rápidos y potentes para liberar el valor de sus datos,  todo en una única plataforma.

Empiece una prueba gratuita

Punto temporal único de una grabación en time-lapse de un microesferoide epitelial mamario cultivado en 3D, donde se resaltan los eventos mitóticos individuales. Procesado con Aivia. Datos cortesía del grupo de imagen inteligente (B. Eismann/C. Conrad en BioQuant/DKFZ Heidelberg)
Punto temporal único de una grabación en time-lapse de un microesferoide epitelial mamario cultivado en 3D, donde se resaltan los eventos mitóticos individuales. Procesado con Aivia. Datos cortesía del grupo de imagen inteligente (B. Eismann/C. Conrad en BioQuant/DKFZ Heidelberg)

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Planes de suscripción de Aivia

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Aivia está disponible mediante suscripción, lo que le brinda la flexibilidad de seleccionar un plan que se adapte a las necesidades de su laboratorio ahora o en el futuro a medida que evolucionen sus necesidades de investigación.

Gracias a la asistencia técnica y a las actualizaciones de software gratuitas durante el periodo de suscripción, siempre dispondrá de la herramienta de análisis basada en IA más actual para su investigación.

  • Go - Las herramientas esenciales para iniciarse en el análisis de imagen con IA
  • Elevate - Eleve su análisis de imagen con IA al siguiente nivel con CellBio o Neuro
  • Apex - Una completa plataforma de análisis de imagen con IA para laboratorios y unidades centrales

1 Aivia Go

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Todo lo que necesita para empezar a analizar imágenes

Aivia Go ofrece herramientas de visualización y análisis de imagen de última generación en una única plataforma, incluyendo múltiples funciones potenciadas por IA, para satisfacer sus exigentes necesidades de visualización y análisis de imágenes. Los sencillos flujos de trabajo de segmentación y las capacidades de procesamiento por lotes generan resultados más rápidamente, ayudándole a saltar de los datos a la publicación.

Aivia Go es compatible con una amplia gama de tareas de análisis de imagen desde 2D hasta 5D, como la detección y el seguimiento. Es el paquete ideal para laboratorios de investigación y unidades centrales de imagen. No requiere conocimientos informáticos.

  • Clasificadores basados en IA
  • Más de 12 recetas de análisis de imagen
  • Visualización de imágenes de 2D a 5D

Funciones

Recetas de análisis de imagen: utilice una amplia gama de recetas de análisis de imagen de 2D a 5D para las aplicaciones de análisis más habituales:

  • Recuento de células, núcleos y partículas en 2D y 3D
  • Seguimiento de células (en contraste de fase y fluorescencia), núcleos y partículas en 2D y 3D
  • Ensayos de proliferación celular y wound healing (contraste de fase)
  • Crecimiento de neuritas
  • Detección de colonias de células madre (contraste de fase) 
  • Seguimiento de células (contraste de fase)

Obtenga un presupuesto o pruebe Aivia de forma gratuita

2 Aivia Elevate

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Eleve su análisis de imágenes con IA al siguiente nivel con los sencillos flujos de trabajo de Aivia

Como solución completa para laboratorios de investigación y unidades centrales de imagen, Aivia Elevate permite a los suscriptores elegir soluciones de IA especializadas para la visualización y el análisis de imágenes de neurobiología o biología celular.

Analice las interacciones celulares y mida las distancias entre diferentes compartimentos hasta el nivel de canal con Elevate for CellBio. Incluye herramientas para la detección precisa de células en imágenes multiplexadas en 2D, la identificación de fenotipos celulares y la exploración de datos. O utilice Elevate for Neuro para automatizar tareas de neuroimagen exigentes, tales como el trazado de neuronas, la segmentación de dendritas, etc.

¿Quiere ambas opciones? Actualice y pase a Aivia Apex para conseguir una funcionalidad plena y la capacidad de aplicar sus propios modelos de aprendizaje profundo.

Funciones 

Recetas de análisis de células o neuronas - Elija entre herramientas de análisis especializadas para la investigación en neurociencia o biología celular

  • Recetas de análisis de neuronas (fluorescencia/ME): Detección y trazado de neuronas en conjuntos de datos 3D
  • Recetas de análisis celular (2D/3D): Observe interacciones celulares complejas en conjuntos de datos 2D y 3D

Obtenga un presupuesto o pruebe Aivia de forma gratuita

3 Aivia Apex

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Una plataforma integral de análisis de imágenes con IA para laboratorios y unidades centrales de imagen

Aivia Apex es una solución integral de análisis de imágenes de microscopía para investigadores que necesitan una variedad de aplicaciones de análisis de imágenes. Apex también brinda a los microscopistas la flexibilidad de aplicar sus propios modelos de aprendizaje profundo, modelos de terceros o repositorios de código abierto.   

El administrador de licencias flotantes de Aivia Apex es ideal tanto para grandes grupos de investigación como unidades centrales de imagen y permite que un sitio ejecute todas las licencias en cualquier máquina de su red local.

  • Todo en Elevate Neuro y CellBio
  • Capacidad de deep learning ampliada
  • Administrador de licencias flotantes

Funciones

Recetas de análisis de imagen:  utilice una amplia gama de recetas de análisis de imagen de 2D a 5D para las aplicaciones de análisis más habituales

  • Recuento y seguimiento de núcleos
  • Recuento y seguimiento de células
  • Recuento y seguimiento de partículas
  • Ensayo de proliferación celular
  • Crecimiento de neuritas
  • Wound healing (contraste de fase)
  • Detección de colonias de células madre (contraste de fase) 
  • Seguimiento de células (contraste de fase)
  • Recetas de análisis y seguimiento de objetos 3D, incluido el análisis de neuronas y células

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